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流式细胞仪在牧草育种中可用来分析牧草的细胞的表面标志和细胞内的抗原物质，同时还能分析细胞的受体和肿瘤细胞的DNA、RNA含量，除此之外还能分析免疫细胞的功能。使用流式细胞术所测到的数据是相对值，所以要在使用前或使用的过程